Perusnäyttelyiden alakerran osio Arkista aherrusta on avattu kesällä 2020 ja yläkerran Käsityön juhlaa -näyttely kesällä 2019. Arkista aherrusta perusnäyttely kertoo käsityön merkityksen muutoksista ihmisten arjessa 1900-luvun aikana. Käsityön juhlaa perusnäyttely esittelee eri elämänvaiheisiin liittyvien juhlien käsitöitä pukeutumisesta koristeisiin. Molemmat näyttelyt pohjautuvat Kärest Pitäen -hankkeeseen, jonka tavoitteena oli tallentaa ja elävöittää paikallista käsityöperinnettä. Museossa on myös vuosittain vaihtuva teemanäyttely.

Käsityömuseo Miilan perustana on vuonna 2008 saatu testamenttilahjoitus. Halikkolainen Lyyli Tuomola lahjoitti koko omaisuutensa Paimion kaupungille sillä ehdolla, että Paimioon perustettaisiin käsityömuseo. Museota ylläpitää Lyyli Tuomolan säätiö.